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癌症基因组分析网站

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licheng 发表于 2015-12-25 23:15:32 | 显示全部楼层 |阅读模式
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肿瘤基因组学数据库终结者:cBioPortal
『cBioPortal网站整合了126个肿瘤基因组研究的数据,包括TCGA和ICGC等大型的肿瘤研究项目,涵盖了两万八千例标本的数据,此外部分样品还包括了临床预后等表型的信息。cBioPortal无需注册就能直接使用,而且提供一些小工具方便用户生成文章级别的图表』



From: Cheng Li
Date: Sun, Jul 28, 2013 at 4:35 PM
Subject: cancer genomics Web resources


International Cancer Genome Consortium Data Portal--a one-stop shop for cancer genomics data. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21930502

Genomics of Drug Sensitivity in Cancer (GDSC): a resource for therapeutic biomarker discovery in cancer cells.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23180760


Visualizing multidimensional cancer genomics data.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23363777


The UCSC Cancer Genomics Browser: update 2013.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23109555


The UCSC Interaction Browser: multidimensional data views in pathway context.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23748957


IPAD: the Integrated Pathway Analysis Database for Systematic Enrichment Analysis.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23046449


SurfaceomeDB: a cancer-orientated database for genes encoding cell surface proteins.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23390370


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