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北京大学生物信息平台“单细胞分析、染色质分析”讨论班

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ltwang 发表于 2018-9-11 12:17:27 | 显示全部楼层 |阅读模式
北京大学生物信息平台讨论班
“单细胞分析、染色质分析”
2018年秋季时间:9月17日开始,每周一19:00-21:30
北京大学王克帧楼348,欢迎在场或在线参与!


联系人:王龙腾(北京大学生科院 李程研究组),微信:Landau1994,邮箱:longtengwang@pku.edu.cn

网上直播间https://live.bilibili.com/h5/12387224
直播账号https://space.bilibili.com/16813275/#/

本期讨论班内容
I. 单细胞分析模块
1.单细胞分析的生物学问题:The biology of single-cell genomics ,9月17日,主讲人:王龙腾(李程组)https://share.weiyun.com/5LgmWyO,(没有回放视频)
2.scRNA-seq data visualization and clustering,10月8日,主讲人:陈文昌 邹子恒(清华大学张学工组)链接:https://share.weiyun.com/5TgOgDM,(视频地址:https://www.bilibili.com/video/av33441560
3.单细胞分析与细胞图谱绘制,10月15日,主讲人:石强(李程组),链接:https://share.weiyun.com/5kljVnj
4.单细胞分析与发育,10月29日,主讲人:李莉(汤富酬组),链接:链接:https://share.weiyun.com/5p7I1Nd
5.单细胞多组学,11月5日,主讲人:张倩(李程组),链接:https://share.weiyun.com/5p7I1Nd


II.染色质分析模块

1.3D genome and its disorganization in diseases,11月19日,主讲人:李瑞风(李程组)链接:https://share.weiyun.com/5p7I1Nd
2.ATAC-seq,分析流程与案例,11月26日,主讲人:孙林华(邓兴旺 钱伟强组)链接:https://share.weiyun.com/5p7I1Nd
3.Introduction to Hi-C experiment and data analysis,12月3日,主讲人:李梦帆(李程组)链接:https://share.weiyun.com/5p7I1Nd
4.基于成像的染色质分析,12月10日,主讲人:侯英萍(李程组)链接:https://share.weiyun.com/5p7I1Nd     
5.染色质分析与多组学整合,12月17日,主讲人:刘玉婷(李程组) 链接:https://share.weiyun.com/5p7I1Nd      
6.染色质分析中的新概念、新方法和新工具,12月24日,主讲人:贾璐萌(李程组)链接:https://share.weiyun.com/5p7I1Nd      

网上资源:
单细胞分析课程:http://hemberg-lab.github.io/scRNA.seq.course/index.html
单细胞分析软件集成:https://github.com/seandavi/awesome-single-cell
染色质与三维基因组分析课程:https://github.com/hms-dbmi/3d-genome-processing-tutorial
https://github.com/hms-dbmi/hic-data-analysis-bootcamp
染色质分析相关软件:https://github.com/dekkerlabhttps://github.com/theaidenlab/juicerhttps://github.com/nservant/HiC-Prohttps://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/HiTC.html


往期讨论班内容

单细胞实验与分析(2018.6-8月)

1. An introduction to bulk and single-cell RNA-seq:2018年6月25日,主讲人:徐子晗(李程组) 链接:https://share.weiyun.com/5dLF79v
2.The advances in scRNA-seq techniques: 2018年7月2日,主讲人:李莉(汤富酬组) 链接:https://share.weiyun.com/59ryjRX
3. Pre-processing and variation of scRNA-seq data:2018年7月9日,主讲人:石强(李程组) 链接:https://share.weiyun.com/5bGebsN
4. scRNA-seq data analysis: Imputation, Cluster, and differential expression: 2018年7月16日,主讲人:李子逸(张泽民组)链接:https://share.weiyun.com/5dN7wuZ
5. scRNA-seq data analysis: single cell trajectory:2018年7月23日,主讲人:张倩(李程组)链接:https://share.weiyun.com/5uXwz15
6. From single-cell RNA-seqto transcription network:2018年7月30日,主讲人:李响(谢晓亮组)链接:https://share.weiyun.com/5ys73Yp
7. 定制单细胞扩增与泛组学测序:2018年8月13日,主讲人:宋立阳(谢晓亮组)链接:
链接:https://share.weiyun.com/5TMLNAk


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