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NAR《核酸研究》数据库专辑介绍

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licheng 发表于 2016-9-23 14:52:18 | 显示全部楼层 |阅读模式
【吴朋泽,2016.9】
——查阅NAR Database issue 2016 (https://nar.oxfordjournals.org/content/44/D1.toc) 。该ISSUE主要是2016年发表在NAR上的与数据库相关的文献,包括了各大数据库网站的更新进展如
NCBI,SIB Swiss Institute,The European Bioinformatics Institute,DNA data bank of Japan等;

也包括一些研究组的进展,如
AU/GU/U-rich elements database, dbSUPER: a database of super-enhancers,NONCODE:long non-coding RNAs,

其中与癌症研究相关的数据库大约有10个,主要研究方向都是给cancer related gene注释,如
——"Lnc2Cancer: a manually curated database of experimentally supported lncRNAs associated with various human cancers",
——"NCG 5.0: updates of a manually curated repository of cancer genes and associated properties from cancer mutational screenings"等,

或者将cancer gene与表型或药物反应关联,如
——"CancerResource—updated database of cancer-relevant proteins, mutations and interacting drugs",
——"canSAR: an updated cancer research and drug discovery knowledgebase",
——"Cancer RNA-Seq Nexus: a database of phenotype-specific transcriptome profiling in cancer cells"等;

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