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如何提出好的研究假说

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licheng 发表于 2016-5-6 16:23:07 | 显示全部楼层 |阅读模式
From: Cheng Li
Date: Monday, April 27, 2015
Subject: 课题思路:好的生物假说

我的导师说过,发现问题,就完成一半工作了。他强调在科研中发现新问题的重要性。

通过阅读文献找到一个好的生物假说,就是一个发现和定义问题的过程。好的假说的特征:

1. 创新性。没有创新,工作难以发表,发表了也没人读,工作失去了价值。创新常通过联系不同的概念(如数据类型)而产生。

2. 具体明了。我们刚开始学习科研,要从简单的问题做起,大问题我们既想不清楚也驾驭不了。能用几句话就解释清楚背景,能用一句话解释清楚假说。假说的这一句话常会成为最终论文的题目。

3. 可行性。好的假说能指明检验假说和它的预测的思路和手段。要考虑课题小组和成员是否有能力在这个假说下很快开展工作,需要哪些实验和计算技能的准备?公共数据和实验室数据中是否有信息检验这个假说?

4. 可修改和扩展。既然是假说,就有不对的可能。假说指引着我们课题的方向,但如果数据分析的结果和假说相悖,就要考虑修改或扩展假说,而前期的工作也是为到达这个更好的假说而服务。

下面是一些正反面的假说例子:

A. Oct4等位基因的染色体存在空间配对现象,寻找和Oct4基因空间接近的基因。

这个不是假说,而是分析手段。既然假说可能指明分析手段,分析手段也往往暗示了一个假说,只是要把它明确讲出来。没有明确的假说,就不能预期分析的结果,得到结果后不知道该和谁比较来解释这些结果(应该和假说或它的预测比较)。

B. lncRNA表达谱能比mRNA或miRNA更好地分类癌症类型和亚型。

“更好地”是个模糊的定义,2%的分类准确性的提高可能是统计显著的,但对临床应用意义不大。99年起开始用基因表达谱分类癌症(创新性),到现在进入临床应用的很少,说明了问题的难度(可行性)。把lncRNA和Hi-C数据结合起来的生物假说更有创新性。

C. 蛋白复合体和非整倍体的关系。

这可以是博士论文的题目,或者开始探索课题时的方向,但不是一个生物假说(关系不具体)。具体化后可修改为一些单个假说:“HMM中的三体染色体的发生避免影响蛋白复合体亚基的表达不平衡性”、“HMM通过改变3D基因组构象抵抗蛋白复合体亚基的表达平衡性受到三体染色体影响”。

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