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贝叶斯分层模型

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licheng 发表于 2016-4-29 09:26:04 | 显示全部楼层 |阅读模式
From: Cheng Li
Date: Wednesday, December 16, 2015
Subject: 科研技能:贝叶斯分层模型

浏览这本书中“Hierarchical model”的章节:
https://share.weiyun.com/4ca831e7e08806f9c34b67648ece9649

搜索pubmed
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubm ... l+%22single+cell%22[tiab]

得到下面文章,浏览看看是否用了分层模型分析单细胞数据、还有没有可做的角度(也联系秦老师报告后大家的讨论)。

也可考虑用分层模型分析时间序列数据(基因之间相互借信息,得到小样本下更可靠的随时间变化的模式),这种模型是我们统计分析进阶的好入口。

BASiCS: Bayesian Analysis of Single-Cell Sequencing Data.

Sincell: an R/Bioconductor package for statistical assessment of cell-state hierarchies from single-cell RNA-seq.

Bayesian hierarchical models for protein networks in single-cell mass cytometry.

A stochastic transcriptional switch model for single cell imaging data.

Mixture models for single-cell assays with applications to vaccine studies.



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