北京大学生物信息平台论坛

 找回密码
 立即注册
搜索
热搜: 通知 活动

【课件】聚类、降维和主成份分析

[复制链接]
licheng 发表于 2016-4-28 11:04:22 | 显示全部楼层 |阅读模式
聚类和PCA的介绍课件
https://share.weiyun.com/6e08ac0bf6351d0ba0420d51c3e8d039

K-means聚类法介绍:
http://m.blog.csdn.net/article/details?id=7914952

聚类应用的例子:
http://forum.cbi.pku.edu.cn/forum.php?mod=viewthread&tid=173

GGobi软件,交互式探索数据降维:http://www.ggobi.org/

示例数据
鸢尾花信息:
http://www.baike.com/wiki/%E9%B8%A2%E5%B0%BE%E8%8A%B1
https://en.wikipedia.org/wiki/Petal

R程序:https://share.weiyun.com/732b27b127358b2b2bac6ed688ac48bd
Iris.png

PCA文献例子
Science 2008 - Worldwide human relationships inferred from genome-wide patterns of variation (PCA Fig 2)
https://share.weiyun.com/9970b1bf53378ea230e3f33364903076

Nature14 Reconstructing lineage hierarchies of the distal lung epithelium using single-cell RNA-seq
https://share.weiyun.com/844f36ce30e4e0ef136ad1dae93d3376

——瑞风重复文章聚类图的代码和数据:
https://share.weiyun.com/76f0a9dd0ddb407deca9f535607c5740

更多例子:
http://forum.cbi.pku.edu.cn/forum.php?mod=viewthread&tid=136



回复

使用道具 举报

北京大学生物信息平台论坛

GMT+8, 2017-9-20 13:44 , Processed in 0.084602 second(s), 26 queries .

Powered by Discuz! X3

© 2001-2013 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表