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与李哲师兄交流生物信息学习

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licheng 发表于 2016-4-12 18:08:09 | 显示全部楼层 |阅读模式
【吴朋泽,2014.4】
上周五与李哲师兄讨论了如何进行生物信息学的学习,我觉得一下内容可能对我们有所帮助:


1. 学习数据分析的方法:
  • 概率与统计,常用的统计模型
  • 学习常用的编程软件:R(统计分析软件,可以从《R intro》开始看),Python(多面能手,可以从《a byte of python》开始看),Perl(文本处理,丰富的库)
  • 选择一个合适的文本编辑器,mac系统推荐使用vim, emacs
  • 多读别人的代码,养成良好的编写代码的习惯
  • 进阶:服务器的使用,bash编程

2. 知道在哪里可以找到有用的资源(代码,数据库,文献等),可以重复利用开源代码,尽量避免自己从头开始编写,可以节省时间且避免出错。

PS:有时间的话可以看看pysam,bedtools,Picard


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