RNA-seq分析服务

基因表达在细胞中是一个动态的过程,在生物生长发育的各个阶段和疾病发生中有着重要的作用,研究全基因组的表达水平能让我们更好地理解这一生物过程、产生新颖假说。随着二代测序技术(Next-Generation Sequencing)的飞速发展,测序成本大幅下降,使得在组学水平研究基因的表达水平更加精确和方便。利用RNA测序技术(mRNA-seq)可以很方便快捷地得到特定细胞在某一功能状态下的整个转录组表达水平。

RNA-seq

模式生物的转录组分析内容

1.标准信息分析详情资料

  • 1) 对原始数据去除接头和低质量序列
  • 2) 数据产出统计和质控评估
  • 3) reads比对到基因组上
  • 4) 比对率,数据污染评估
  • 5) 基因表达定量
  • 6) 样本相关性分析,样本聚类分析
  • 7) 基因差异表达分析 (多组样本)
  • 8) 差异基因表达模式聚类分析
  • 9) 差异基因GO功能富集分析
  • 10) 差异基因Pathway(KEGG)显著性分析
  • 11) 鉴定基因的可变剪切 (需有生物学重复)
  • 12) mRNA上的SNP分析
  • 13) mRNA上的Indel分析

  • 2.定制化信息分析

  • 可根据实验室的具体要求定制化信息分析内容。